Inovasi terbaru dalam permainan virtual reality akan dipamerkan secara eksklusif, dengan anak-anak dari kalangan elit Jepang diberi kesempatan untuk menguji coba permainan tersebut. Sayangnya, kesenangan mereka yang bebas itu terhenti ketika seorang karyawan perusahaan ditemukan tewas, dengan pesan terakhirnya mengarah pada petunjuk yang tersembunyi dalam latar belakang sejarah permainan.
Bersama Detective Boys dan Ran Mouri, Conan Edogawa masuk ke dalam permainan untuk memecahkan misteri ini dan memastikan pelaku ditangkap. Namun, begitu mereka masuk, kecerdasan buatan bernama Noah’s Ark menahan mereka dan anak-anak lainnya di dalam permainan. Untuk melarikan diri dan membawa pembunuh ke pengadilan, Conan dan kawan-kawan harus menjelajahi London abad ke-19 yang disimulasikan dan melacak Jack the Ripper yang terkenal—dengan nyawa 50 anak tak bersalah tergantung pada mereka.
