Yuuta Takemoto, seorang mahasiswa tingkat dua di sebuah perguruan tinggi seni, berbagi apartemen murah dengan dua senior—Shinobu Morita yang eksentrik, yang terus gagal lulus karena sering bolos, dan Takumi Mayama yang bijaksana, yang bertindak sebagai senior yang baik bagi Takemoto, sering memperhatikan dan membantunya.
Takemoto tidak pernah memikirkan masa depannya hingga suatu hari di musim semi, ketika ia bertemu dengan Hagumi Hanamoto yang menawan dan jatuh cinta pada pandangan pertama. Hagumi, yang sangat berbakat dalam seni, mendaftar di universitas Takemoto dan segera berteman dengan Ayumi Yamada, seorang mahasiswa keramik yang populer. Ayumi sudah mengenal ketiga teman sekamar tersebut dan diam-diam menyimpan perasaan mendalam terhadap salah satu dari mereka.
Hachimitsu to Clover adalah kisah hangat tentang masa muda, cinta, pencarian jati diri, dan penemuan diri, yang terjalin secara rumit melalui hubungan kompleks antara lima sahabat karib.
